Факультет усовершенствования врачей при Горьковском медицинском институте был создан в 1966 г., под руководством декана проф. Л. Ф. Черемухина. Первыми кафедрами факультета были кафедры терапии и хирургии, повышения квалификации врачей. Кафедру терапии ФУВ с момента основания и до августа 2000 года возглавляла профессор, заслуженный деятель науки России Е. В. Камышева. Кафедра хирургии ФУВ организована профессором И. Л. Ротковым, который возглавлял кафедру до 1998 г. Кафедры обучали ежегодно по 100-150 курсантов Горького и области.

С конца 70-х годов работой факультета руководил декан проф. Е. В. Шахов. Недостаток преподавательских ставок, учебных площадей, отсутствие общежития для иногородних курсантов в течение долгого времени тормозили развитие последипломного образования. Тем не менее с начала 80-х годов при многих студенческих кафедрах стали проводиться циклы общего усовершенствования для врачей.

Следующим этапом развития системы последипломного образования института стало формирование курсов повышения квалификации врачей в составе студенческих кафедр. С 1983 года были открыты: курс лучевой диагностики под руководством проф. И. Б. Дынник при кафедре госпитальной хирургии, курс социальной гигиены и организации здравоохранения под руководством проф. Л. Л. Кузнецовой при одноименной студенческой кафедре и курс токсикологии под руководством проф. И. А. Климова. Таким образом часть врачей города и области, а так же сотрудников института получили возможность проходить повышение квалификации в Горьковском медицинском институте.

С конца 80-х годов из курсов стали формироваться кафедры. К 1989 году в состав факультета входило 5 самостоятельных кафедр. Потребности практического здравоохранения росли, и к началу 90-х годов стала очевидна необходимость расширения системы последипломного образования в структуре Горьковского медицинского института. В этот период деканом факультета был проф. Н. А. Макаров. За время его работы с 1989 по 1994 гг. количество кафедр на факультете увеличилось до 10. В 1990 г. из одноименного курса сформировалась кафедра педиатрии под руководством проф. В. А. Воробьевой на базе Нижегородской детской областной клинической больницы, в 1991 г. - кафедра травматологии, ортопедии и термических поражений на базе НИИТО, под руководством проф. Е. Ю. Ежова, в 1993 г. - кафедра гигиены и эпидемиологии, возглавляемая проф. И. Ф. Колпащиковой и кафедра неврологии и медицинской реабилитации с курсом геронтологии, под руководством проф. А. В. Густова. Количество врачей, прошедших обучение на факультете усовершенствования за 1994 г. достигло 2400 человек. С этого же периода времени стали проводится эпизодические выездные циклы в города области. Увеличение количества кафедр потребовало проведения большого объема методической работы. С 1994 года на факультете введена единая отчетная документация, разработаны учебные программы по единой форме, утвержденной методическим советом. Необходимость постоянного совершенствования педагогического мастерства преподавателей НГМА потребовала создания в 1994 году отделения повышения квалификации преподавателей.

Столь значительное увеличение объема работы сделало необходимым выделение с 1994 года самостоятельной должности для руководства последипломным образованием института. Первым проректором по последипломному образованию и лечебной работе стал проф. А. В. Густов, возглавляющий в настоящее время кафедру неврологии и психиатрии последипломного образования. Деканом факультета усовершенствования врачей с 1994 года работала проф. И. Ф. Колпащикова, заведующая кафедрой профилактической медицины. С 1996 года во исполнение приказа МЗ МП РФ от 19.12.94 г. N 286 "Об утверждении положения о порядке допуска к осуществлению профессиональной (медицинской и фармацевтической) деятельности" одной из главных задач учебного процесса явилась подготовка и проведение сертификационных циклов. В период с 1996 по 1998 гг. были созданы кафедры клинической лабораторной диагностики под руководством проф. К. Н. Конторщиковой, геронтологии и общей врачебной практики на базе Нижегородского геронтологического центра под руководством проф. Н. И. Жулиной, выделилась из студенческой кафедры под руководством доц. Н. А. Егоровой кафедра акушерства и гинекологии, начала работу кафедра стоматологии под руководством проф. С. И. Гажвы.